生态农业的特征主要表现在综合性、多样性、高效性、持续性。
生态农业是农、林、牧、副、渔各种农业综合的大农业，而且它还是农业种植、养殖、加工、销售、旅游综合起来的，能够适应市场经济发展的现代农业。生态农业主要强调发挥农业生态系统的整体功能，按“整体、协调、循环、再生”的原则，将农业全面规划，调整、优化。这样可以使农、林、牧、副、渔各业和农村一、二、三产业综合发展，然后使各业之间互相支持，提高综合生产能力。
生态农业针对我国的地域和各地自然条件、资源基础、经济与社会发展水平差异较大的情况，然后吸收我国传统农业精华，再结合现代科学技术，以多种生态模式、生态工程和技术类型装备开启的新农业生产。生态农业可以使各区域都扬长避短，充分发挥地区优势。
生态系统破坏是人类社会活动引起的生态退化，生态系统会导致环境结构和功能发生变化，对人类生存发展以及环境本身也会产生不利影响。生态环境破坏主要包括:水土流失、沙漠化、荒漠化、森林锐减、土地退化、生物多样性的减少，湖泊的富营养化、地下水漏斗、地面下沉等。